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MASCOT Distiller

작성자 관리자 날짜 2024-10-08 19:20:00 조회수 47

Mascot Distiller Workstation은 다양한 native(binary) 질량 분석 data files에 대해 직관적인 인터페이스를 제공합니다. Raw data는 고품질의 de-isotoped 피크 리스트로 처리합니다.

Mascot Distiller는 다음 업체에서 제조한 질량분석기의 모든 데이터 파일 형식을 지원합니다

  • SCIEX
  • Agilent
  • Bruker
  • Jeol
  • Shimadzu
  • Thermo Scientific
  • Waters
  • mzXML 2.0 and 2.1 (XML interchange format)
  • mzML 1.1 (XML interchange format)
  • Text (ASCII mass and intensity values)

하나 이상의 Toolbox options을 추가하여 Mascot 검색 결과 검토, 자동 및 수동 de novo sequencing, batch processing 및 정량 분석을 할 수 있습니다.

Daemon Toolbox

Mascot Daemon Toolbox를 사용하면 Mascot Daemon에서 Mascot Distiller 라이브러리를 호출하여 데이터 파일을 일괄 처리하고 검색 결과를 Mascot Server에 제출할 수 있습니다.

Peak lists는 자동으로 디스크에 저장되고 Distiller 프로젝트 파일도 생성할 수 있으므로 Daemon에서 하이퍼링크를 클릭하여 raw data와 peak lists를 Distiller에서 열 수 있습니다.

Search Toolbox가 있는 경우 검색 결과도 Distiller 프로젝트 파일에 저장됩니다.

Quantitation Toolbox가 있는 경우 peak picking에서 Distiller 프로젝트를 정량 보고서와 함께 저장하는 것까지 정량 실험의 모든 단계를 일괄 자동화할 수 있습니다. (참고: Mascot Daemon은 Mascot Server 패키지의 구성 요소입니다.)

Search Toolbox

Search Toolbox는 단백질 식별 및 특성화를 위한 도구 모음입니다.

 

  • Mascot Distiller 내에서 Mascot 검색 결과 표시
  • Automatic de novo sequencing
  • Automatic sequence tag calling
  • Manual de novo and sequence tag
  • Peptide sequence에서 fragment ions을 예측하고 MS/MS spectrum에 overlay
  • Protein digest에서 질량 값을 예측하고 spectrum에 overlay

 

 

Search Toolbox에는 강력한 de novo sequencing 알고리즘이 포함되어 있습니다.

 

 

Quantitation Toolbox

Servey scan에서 precursors에 대한 extracted chromatogram의 상대적인 intensities에 기반한 정량화를 구현합니다.

이 접근 방식은 "label-free"로 사용할 수 있거나, 예를 들어 18O, AQUA, ICAT, ICPL, Metabolic labelling 및 SILAC과 같이 precursor mass shift를 생성하는 모든 화학 물질과 함께 사용할 수 있습니다.

 

 

 

Developer Toolbox

Developer Toolbox에는 Mascot Distiller 라이브러리를 호출하는 프로그램을 개발하고 실행하기 위한 설명서와 지원이 들어 있습니다.

Distiller는 COM을 사용하므로 대부분의 Microsoft Windows 프로그래밍 언어에서 호출할 수 있습니다.

Developer Toolbox는 모든 다양한 raw 파일 형식에 대한 균일한 애플리케이션 프로그래머 인터페이스를 제공하여 개발 시간을 크게 단축합니다.

 

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